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映射数百万个短读，在色彩空间中解码读，可视化映射结果

ZOOM Lite 截图

ZOOM Lite 编辑评价

ZOOM Lite是下一代测序数据映射和可视化软件。用户输入参考基因组，Illumina / Solexa short读取文件或AB SOLiD色彩空间读取各种格式的文件，例如* .fasta，*。fastq，* _ seq.txt，*。csfasta等。ZOOM输出这些short的映射结果读取参考序列。 ZOOM Lite具有基于新设计的多重间隔种子理论的快速而准确的映射内核。可以处理长度范围从15bp到240bp的单端和双端读取。允许在阅读序列与其参考序列上的靶标区域之间进行任意数量的错配和一个插入/缺失各种长度的修饰。每次读取的唯一映射结果或最佳（前N个）结果将根据最小错配和插入缺失长度进行报告。质量得分用于增强映射精度。 ZOOM Lite基于映射内核，允许用户加载本地读取数据和参考序列数据，选择合适的参数，在多达四个CPU之间并行处理大量数据，监视运行的任务，存储映射结果，查看图形映射结果和输出映射结果采用* .BED或* .GFF文件格式，以便进一步使用UCSC浏览器跟踪信息进行勘测。可以以任何所需的比例查看制图结果，从整个染色体上的读取深度图到读取序列与参考序列之间的详细序列比对。用户只需单击并拖动或滚动即可轻松导航到感兴趣的区域。 ZOOM Lite是ZOOM Studio软件的衍生产品。

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