1. Windows
2. Educatieve Software
3. Wetenschap Software
4. ZOOM Lite Downloaden

Breng miljoenen korte reads in kaart, decodeer reads in kleurruimte, visualiseer kaartresultaten

ZOOM Lite Screenshots

ZOOM Lite Cijfer redacteuren

ZOOM Lite is een next-generation sequencing data mapping en visualisatie software. Gebruikers voeren referentie genomen in en Illumina / Solexa leest korte bestanden of AB SOLiD-kleurruimte leest bestanden in verschillende formaten, zoals * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta enz. ZOOM voert de mappingresultaten van deze korte uit leest over de referentiereeks. ZOOM Lite heeft een snelle en nauwkeurige mapping-kernel gebaseerd op een nieuw ontworpen multiple spaced seed-theorie. Zowel single-end als paired-end reads van verschillende lengtes van 15 bp tot 240 bp kunnen worden verwerkt. Elk aantal verkeerde combinaties en één invoeging / verwijdering van verschillende lengtes tussen het gelezen en het doelgebied op de referentiesequentie zijn toegestaan. Uniek in kaart gebrachte resultaten of de beste (top N) resultaten voor elke uitlezing worden gerapporteerd volgens de minimale mismatches en indellengte. Kwaliteitsscores worden gebruikt om de nauwkeurigheid van de kaart te verbeteren. Op basis van de toewijzingskernel, stelt ZOOM Lite gebruikers in staat om lokale gelezen gegevens en referentiereeksgegevens te laden, de juiste parameters te selecteren, hoogvolumegegevens parallel te verwerken tussen maximaal vier CPU's, de lopende taken te bewaken, de toewijzingsresultaten op te slaan, de grafieken van te bekijken mapping resultaten en output mapping resultaten in * .BED of * .GFF bestandsformaten voor verder onderzoek met de UCSC browser track informatie. Mappingresultaten kunnen op elke gewenste schaal worden bekeken, van de leesdieptegrafiek over een heel chromosoom tot gedetailleerde sequentie-uitlijningen tussen reads en de referentiereeks. Gebruikers navigeren eenvoudig naar interessante regio's door simpelweg te klikken en te slepen of te scrollen. ZOOM Lite is een afgeleide van de ZOOM Studio-software.

Similar Suggested Software

Icecream Ebook Reader

Opslaan, beheren en lezen van e-books van verschillende formaten .

Alco-Calculator for Windows 10

houd uw BAC (Blood Alcohol Content) bij

Quran Majeed with Search

Lees de Heilige Koran in het Arabisch, Urdu en Engels

SO-Unconfined

Evalueer onbeperkte compressietests

2D Frame Analysis Static Edition

Voer een breed scala aan berekeningen uit op 2D-constructies

Kintecus

Voer chemische kinetiek uit van verbranding, katalysatorreactor en enzymreacties