1. Windows
2. Образовательные Программы
3. Наука Программное обеспечение
4. ZOOM Lite Скачать

Карта миллионов коротких чтений, декодирование чтения в цветовом пространстве, визуализация результатов сопоставления

ZOOM Lite Скриншоты

ZOOM Lite Рейтинг редакции

ZOOM Lite - это программное обеспечение для отображения и визуализации данных следующего поколения. Пользователи вводят эталонные геномы и короткие чтения файлов Illumina / Solexa или цветовое пространство AB SOLiD для чтения файлов в различных форматах, таких как * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta и т. Д. ZOOM выводит результаты сопоставления этих коротких файлов. читает на ссылочной последовательности. ZOOM Lite имеет быстрое и точное картографическое ядро, основанное на недавно разработанной теории множественных начальных чисел. Могут обрабатываться как односторонние, так и парные операции чтения различной длины от 15 до 240 б.п. Любое количество несовпадений и один вставка / удаления различных длин между прочитанным и его целевой областью на эталонной последовательности разрешено. Уникально сопоставленные результаты или наилучшие (top N) результаты для каждого чтения будут сообщаться в соответствии с минимальными несовпадениями и неопределенной длиной. Показатели качества используются для повышения точности картирования. Основываясь на ядре сопоставления, ZOOM Lite позволяет пользователям загружать локальные данные чтения и данные эталонной последовательности, выбирать надлежащие параметры, параллельно обрабатывать большие объемы данных между четырьмя ЦП, отслеживать текущие задачи, сохранять результаты сопоставления, просматривать графики результаты сопоставления и результаты сопоставления выходных данных в форматах файлов * .BED или * .GFF для дальнейшей съемки с помощью информации о дорожках браузера UCSC. Результаты картирования можно просматривать в любом желаемом масштабе, от графика глубины чтения по всей хромосоме до детального выравнивания последовательностей между чтениями и эталонной последовательностью. Пользователи могут легко перемещаться по интересующим регионам простым нажатием и перетаскиванием или прокруткой. ZOOM Lite является производной от программного обеспечения ZOOM Studio.

Similar Suggested Software

Geodetic

Выполните геодезических расчетов для различных показателей .

Alco-Calculator for Windows 10

следить за своим BAC (содержание алкоголя в крови) .

Quran Majeed with Search

Читайте Священный Коран на арабском, урду и английском языках

SO-Unconfined

Оцените тесты неограниченного сжатия

Kintecus

Проведите химическую кинетику горения, каталитического реактора и ферментативных реакций

Global Mapper

Работайте с различными картами и выполняйте растушевку, спектральный анализ и настройку контраста