ZOOM Lite Lataa ja asenna

Lataa (41.79MB)

ZOOM Lite Tietoja

ZOOM Lite Erittelyt

Versio:
1.5

Tiedostokoko:
41.79MB

Lisätty:
30. toukokuuta 2020

Päivämäärä vapautetaan:
18. toukokuuta 2010

Hinta:
Free

Käyttöjärjestelmä:
Windows XP/Vista/7,

Lataukset viime viikolla:
203

Lisävaatimuksia
Ei mitää

ZOOM Lite v1.5

Kartta miljoonia lyhyitä lukemia, dekoodaa lukemat väriavaruudessa, visualisoida kartoitustulokset

ZOOM Lite Kuvakaappauksia

ZOOM Lite Editors 'luokitus

ZOOM Lite on seuraavan sukupolven sekvensointitietojen kartoitus- ja visualisointiohjelmisto. Käyttäjät syöttävät viitegenomeja ja Illumina / Solexa short lukee tiedostoja tai AB SOLiD -väriavaruus lukee tiedostoja eri muodoissa, kuten * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta jne. ZOOM tuottaa näiden lyhyiden kartoitustulokset. lukee referenssisekvenssistä. ZOOM Lite: llä on nopea ja tarkka kartoitusydin, joka perustuu äskettäin suunniteltuun, useiden etäisyyksien siementen teoriaan. Sekä yksipuolisia että pareittain lukevia kappaleita, joiden pituus on 15–240 bp, voidaan käsitellä. Minkä tahansa lukumäärän epäsuhta ja yksi eripituinen lisäys / poisto lukeman ja sen kohdealueen välillä referenssisekvenssissä ovat sallittuja. Yksilöllisesti kartoitetut tulokset tai parhaat (parhaat N) tulokset jokaisesta lukemasta raportoidaan pienimpien yhteensopimattomuuksien ja indel-pituuden mukaan. Laatupisteitä käytetään parantamaan kartoituksen tarkkuutta. Karttakartan ytimen perusteella ZOOM Lite antaa käyttäjille mahdollisuuden ladata paikallista lukutietoa ja referenssisekvenssitietoja, valita oikeita parametreja, prosessoida suuren määrän tietoja samanaikaisesti jopa neljän prosessorin keskuudessa, seurata käynnissä olevia tehtäviä, tallentaa kartoitustuloksia, tarkastella kuvaajia tulosten kartoittaminen ja tulosteen kartoitustulokset joko * .BED- tai * .GFF-tiedostomuodoissa tarkkailun jatkamiseksi UCSC-selaimen raidan tietojen kanssa. Kartoitustuloksia voidaan tarkastella missä tahansa halutussa mittakaavassa, lukemisen syvyysdiagrammista koko kromosomin läpi yksityiskohtaisiin sekvenssien kohdistuksiin lukemien ja referenssisekvenssien välillä. Käyttäjät navigoivat mielenkiintoisiin alueisiin helposti napsauttamalla ja vetämällä tai vierittämällä. ZOOM Lite on johdannainen ZOOM Studio-ohjelmistosta.

Lataa (41.79MB)

Similar Suggested Software