1. Windows
2. Pedagogisk Programvare
3. Science Software
4. ZOOM Lite Last ned

Kartlegg millioner av korte avlesninger, dekoder avlesninger i fargerom, visualiser kartleggingsresultater

ZOOM Lite Skjerm

ZOOM Lite Editors 'rating

ZOOM Lite er en neste generasjons programvare for sekvensering av datakartlegging og visualisering. Brukere legger inn referansegenomener og Illumina / Solexa kortleser filer eller AB SOLiD fargerom leser filer i forskjellige formater, for eksempel * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta etc. ZOOM gir kartleggingsresultatene for disse korte leser på referansesekvensen. ZOOM Lite har en rask og nøyaktig kartleggingskjerne basert på en nyutviklet teori med flere mellomrom. Både lesere med en ende og sammenkoblet ende i forskjellige lengder fra 15 bp til 240 bp kan håndteres. Et hvilket som helst antall feilparringer og en innsetting / sletting av forskjellige lengder mellom avlesningen og dens målregion i referansesekvensen er tillatt. Unikt kartlagte resultater eller beste (øverste N) -resultat for hver avlesning vil bli rapportert i henhold til minimale misforhold og indelengde. Kvalitetspoeng brukes for å forbedre kartnøyaktigheten. Basert på kartleggingskjernen lar ZOOM Lite brukere laste lokale lesedata og referansesekvensdata, velge riktige parametere, behandle data med høyt volum parallelt mellom opptil fire CPU-er, overvåke løpsoppgavene, lagre kartleggingsresultatene, se grafene over kartleggingsresultater og output kartleggingsresultater i enten * .BED- eller * .GFF-filformater for videre kartlegging med UCSC-nettlesersporinformasjon. Kartleggingsresultater kan sees i hvilken som helst ønsket skala, fra grafen for lese dybde over et helt kromosom til detaljerte sekvensjusteringer mellom leser og referansesekvensen. Brukere navigerer enkelt til regioner av interesse bare ved å klikke og dra eller bla. ZOOM Lite er et derivat av ZOOM Studio-programvaren.

Similar Suggested Software

Icecream Ebook Reader

Lagre, håndtere og lese e-bøker i ulike formater .

Alco-Calculator for Windows 10

holde oversikt over BAC (blodalkoholinnhold) .

RAPTOR

Produser nøyaktige datamodeller av proteiner basert på proteintråding

SO-Unconfined

Evaluer ubegrensede kompresjonstester

2D Frame Analysis Static Edition

Utfør et bredt spekter av beregninger på 2D-strukturer

Global Mapper

Arbeid med forskjellige kart og utfør fjæring, spektralanalyse og kontrastjustering