1. Windows
2. Undervisningssoftware
3. Science Software
4. ZOOM Lite Hent

Kortlæg millioner af korte aflæsninger, afkoder læser i farverum, visualiser kortlægningsresultater

ZOOM Lite Screenshots

ZOOM Lite Editors 'rating

ZOOM Lite er en næste generations software til kortlægning og visualisering af data. Brugere input referencer genomer og Illumina / Solexa kortlæser filer eller AB SOLiD farverum læser filer i forskellige formater, såsom * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta osv. ZOOM udsender kortlægningsresultaterne af disse korte læser på referencesekvensen. ZOOM Lite har en hurtig og nøjagtig kortlægningskerne, der er baseret på en nydesignet multipel frøteori. Både enkelt-og par-end-læsninger i forskellige længder fra 15 bp til 240 bp kan håndteres. Ethvert antal uoverensstemmelser og en indsættelse / sletning af forskellige længder mellem aflæsningen og dens målregion i referencesekvensen er tilladt. Unikt kortlagte resultater eller bedste (top N) resultater for hver aflæsning rapporteres i henhold til de minimale uoverensstemmelser og indelængde. Kvalitetsresultater bruges til at forbedre kortlægningsnøjagtigheden. Baseret på kortlægningskernen giver ZOOM Lite brugere mulighed for at indlæse lokale læse data og referencesekvensdata, vælge korrekte parametre, behandle data med højt volumen parallelt mellem op til fire CPU'er, overvåge de kørende opgaver, gemme kortlægningsresultaterne, se graferne over kortlægning af resultater og output kortlægningsresultater i enten * .BED eller * .GFF filformater til yderligere kortlægning med UCSC browsersporinformation. Kortlægningsresultater kan ses i en hvilken som helst ønsket skala, fra lædedybde-grafen over et helt kromosom til detaljerede sekvensjusteringer mellem læsninger og referencesekvensen. Brugere navigerer let til regioner af interesse blot ved at klikke og trække eller rulle. ZOOM Lite er et derivat af ZOOM Studio-softwaren.

Similar Suggested Software

Geodetic

Udføre geodætiske beregninger for forskellige målinger .

Alco-Calculator for Windows 10

holde styr på din BAC (blod alkoholindhold) .

Quran Majeed with Search

Læs den hellige Koran på arabisk, urdu og engelsk

SO-Unconfined

Evaluer ikke-begrænsede kompressionstest

Kintecus

Kør kemisk kinetik ved forbrænding, katalysatorreaktor og enzymreaktioner

Global Mapper

Arbejd med forskellige kort og udfør fjer, spektralanalyse og kontrastjustering