1. Windows
2. Educatieve Software
3. Wetenschap Software
4. RAPTOR Downloaden

Produceer nauwkeurige computermodellen van eiwitten op basis van proteïne-threading

RAPTOR Screenshots

RAPTOR Cijfer redacteuren

RAPTOR is een innovatieve software die is ontworpen voor nauwkeurige voorspelling van de eiwitstructuur. Het combineert geavanceerde analysetools in één geïntegreerde softwareoplossing en biedt drie verschillende threading-methoden. RAPTOR's unieke integer-programmeeroptimalisatiebenadering is het meest effectief voor het vinden van structuursjablonen van doelen met lage sequentiehomologie en is in staat om modellen van hoge kwaliteit te genereren. De gebruiksvriendelijke interface en gemakkelijk te begrijpen E-waarden zijn ideaal voor beginners en experts. Bovendien stelt de intuïtieve weergave van de output gebruikers in staat om de resultaten in één oogopslag te begrijpen. Gegeven een doeleiwitsequentie, als er een homoloog eiwit is met een bekende 3D-structuur, kan dit worden gevonden met behulp van sequentie-zoekinstrumenten zoals PSI-BLAST, ook beschikbaar in RAPTOR. De structuur van het doel wordt dan opgebouwd uit de bekende structuur; als de sequentiehomologie echter niet significant is, d.w.z. minder dan 25%, kan PSI-BLAST geen zelfverzekerde hit opleveren. In tegenstelling tot PSI-BLAST, dat simpelweg een sequentie-zoektocht doet, proteïne threading, vouwherkenning, gebruik maakt van zowel homologie als structuurinformatie. Het scant de eiwitsequentie met een onbekende structuur tegen een database met bekende structuren. Door een scorefunctie te gebruiken en compatibiliteitsanalyse uit te voeren tussen driedimensionale structuren en lineaire eiwitsequenties, zal het beste structurele sjabloon worden geïdentificeerd waaruit de structuur van de sequentie kan worden opgebouwd. Als resultaat geeft proteïne-threading een betere voorspelling dan homologiemodellering wanneer er marginale sequentiehomologie is.

Similar Suggested Software

MathType

Bewerk uw wiskundige vergelijking.

Hebrew Words

Vertaal Hebreeuwse bijbelverzen woord voor woord

Albireo Astronomy Toolbox

Krijg toegang tot verschillende astronomie-gerelateerde gegevens en simulaties in één app

ZOOM Lite

Breng miljoenen korte reads in kaart, decodeer reads in kleurruimte, visualiseer kaartresultaten