RAPTOR Specifikationer
|
Producer nøjagtige computermodeller af proteiner baseret på proteintrådning
RAPTOR er en innovativ software designet til nøjagtig forudsigelse af proteinstruktur. Den kombinerer avancerede analyseværktøjer i en integreret softwareløsning og giver tre forskellige threading-metoder. RAPTORs unikke heltalsprogrammeringsoptimeringsmetode er mest effektiv til at finde strukturskabeloner til mål med lav sekvenshomologi og er i stand til at generere modeller af høj kvalitet. Den brugervenlige grænseflade og de letforståelige E-værdier er ideelle til begyndere og eksperter. Frem for alt giver den intuitive visning af output brugerne mulighed for blot at forstå resultaterne med det samme. Givet en målproteinsekvens, hvis der er et homologt protein med kendt 3D-struktur, kan det findes ved hjælp af sekvenssøgningsværktøjer som PSI-BLAST, også tilvejebragt i RAPTOR. Målets struktur bygges derefter ud fra den kendte struktur; når sekvenshomologien imidlertid ikke er signifikant, dvs. mindre end 25%, kan PSI-BLAST ikke komme med et selvsikker hit. I modsætning til PSI-BLAST, som simpelthen foretager en sekvenssøgning, gør proteintrådning, foldegenkendelse brug af både homologi og strukturinformation. Det scanner proteinsekvensen med en ukendt struktur mod en database med kendte strukturer. Ved at bruge en scoringsfunktion og udføre kompatibilitetsanalyse mellem tredimensionelle strukturer og lineære proteinsekvenser, identificeres den bedste strukturelle skabelon, hvorfra sekvensens struktur kan bygges. Som et resultat giver proteintrådning en overlegen forudsigelse end homologimodellering, når der er marginal sekvenshomologi.
Start-Prof 232 |
Earthquake 3D 203 |
MandelX 203 |
Im2graph 203 |
NI Multisim 203 |
Planetarium 3D for Windows 10 203 |
Google Earth 203 |
HiView 203 |
Tracker 203 |
Gravity Nu 203 |