RAPTOR Ladda ner och installera

Ladda ner (546.62MB)

RAPTOR Om

RAPTOR Specifikationer

Version:
4.5

Storlek:
546.62MB

Datum tillagd:
6 september 2020

Datum släpptes:
10 maj 2010

Pris:
Free to try

Operativsystem:
Windows XP/Vista/7,

Nedladdningar förra veckan:
203

Ytterligare krav
Inge

RAPTOR v4.5

Producera exakta datormodeller av proteiner baserat på proteintrådning

RAPTOR Screenshots

RAPTOR Editors betygsättning

RAPTOR är en innovativ mjukvara utformad för noggrann förutsägelse av proteinstruktur. Den kombinerar avancerade analysverktyg i en integrerad programvarulösning och ger tre olika trådmetoder. RAPTORs unika helhetsprogrammeringsoptimeringsmetod är mest effektivt för att hitta strukturmallar för mål med låg sekvenshomologi och kan skapa modeller av hög kvalitet. Det lättanvända gränssnittet och de lättförståeliga E-värdena är idealiska för nybörjare och experter. Framför allt gör den intuitiva visningen av utdata användarna att förstå resultaten helt enkelt en överblick. Med tanke på en målproteinsekvens, om det finns ett homologt protein med känd 3D-struktur, kan det hittas med hjälp av sekvenssökningsverktyg som PSI-BLAST, som också tillhandahålls i RAPTOR. Målets struktur byggs sedan från den kända strukturen; emellertid, när sekvenshomologin inte är signifikant, dvs. mindre än 25%, kan PSI-BLAST inte komma med en säker träff. Till skillnad från PSI-BLAST, som helt enkelt gör en sekvenssökning, använder proteintrådning, veckigenkänning både homologi och strukturinformation. Den skannar proteinsekvensen med en okänd struktur mot en databas med kända strukturer. Genom att använda en poängfunktion och genomföra kompatibilitetsanalys mellan tredimensionella strukturer och linjära proteinsekvenser kommer den bästa strukturmallen att identifieras från vilken sekvensens struktur kan byggas. Som ett resultat ger proteintrådning en överlägsen förutsägelse än homologimodellering när det finns marginal sekvenshomologi.

Ladda ner (546.62MB)

Similar Suggested Software