ZOOM Lite Indirin ve yükleyin

Indirin (41.79MB)

ZOOM Lite Hakkında

ZOOM Lite Özellikler

Sürüm:
1.5

Dosya boyutu:
41.79MB

Tarih ekledi:
30 Mayıs 2020

Tarih yayınladı:
18 Mayıs 2010

Fiyat:
Free

İşletim sistemi:
Windows XP/Vista/7,

Dosyalar son hafta:
203

Ek Gereksinimler
Yo

ZOOM Lite v1.5

Milyonlarca kısa okumayı haritalayın, renk uzayındaki okumaların kodunu çözün, haritalama sonuçlarını görselleştirin

ZOOM Lite Ekran

ZOOM Lite Editörün değerlendirmesi

ZOOM Lite, yeni nesil bir sekanslama veri haritalama ve görselleştirme yazılımıdır. Kullanıcılar referans genomları ve Illumina / Solexa kısa dosyaları okur veya AB SOLiD renk alanı dosyaları * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta vb. Gibi çeşitli biçimlerde okur. ZOOM bu kısa eşleme sonuçlarını çıkarır referans dizisini okur. ZOOM Lite, yeni tasarlanmış çok aralıklı tohumlar teorisine dayanan hızlı ve doğru bir haritalama çekirdeğine sahiptir. 15bp ila 240bp arasında çeşitli uzunluklarda hem tek uçlu hem de çift uçlu okumalar işlenebilir. İstenen sayıda eşleşmeme ve referans dizilimdeki okuma ve hedef bölgesi arasında çeşitli uzunluklarda bir ekleme / silme işlemine izin verilir. Her bir okuma için benzersiz olarak eşlenmiş sonuçlar veya en iyi (en iyi N) sonuçlar, minimum uyumsuzluklara ve indel uzunluğuna göre raporlanır. Haritalama doğruluğunu artırmak için kalite puanları kullanılır. Eşleme çekirdeğini temel alan ZOOM Lite, kullanıcıların yerel okuma verilerini ve referans dizi verilerini yüklemelerine, uygun parametreleri seçmelerine, dört CPU'ya kadar paralel olarak yüksek hacimli verileri işlemesine, çalışan görevleri izlemesine, haritalama sonuçlarını depolamasına, grafiklerini görüntülemesine olanak tanır. eşleme sonuçları ve çıktı eşleme sonuçları UCSC tarayıcısı parça bilgileriyle daha fazla inceleme için * .BED veya * .GFF dosya biçimlerinde sonuçlanır. Haritalama sonuçları, okuma derinliği grafiğinden tüm bir kromozom üzerinde istenen okuma ölçeğinde, okumalar ve referans dizi arasındaki ayrıntılı dizi hizalamalarına kadar görüntülenebilir. Kullanıcılar ilgilendikleri bölgelere kolayca tıklayıp sürükleyerek veya kaydırma yaparak kolayca gidebilirler. ZOOM Lite, ZOOM Studio yazılımının bir türevidir.

Indirin (41.79MB)

Similar Suggested Software