ZOOM Lite Ladda ner och installera

Ladda ner (41.79MB)

ZOOM Lite Om

ZOOM Lite Specifikationer

Version:
1.5

Storlek:
41.79MB

Datum tillagd:
30 maj 2020

Datum släpptes:
18 maj 2010

Pris:
Free

Operativsystem:
Windows XP/Vista/7,

Nedladdningar förra veckan:
203

Ytterligare krav
Inge

ZOOM Lite v1.5

Kartlägga miljontals kortläsningar, avkoda avläsningar i färgutrymme, visualisera kartläggningsresultat

ZOOM Lite Screenshots

ZOOM Lite Editors betygsättning

ZOOM Lite är en nästa generations programvara för kartläggning och visualisering av sekvenseringsdata. Användarnas inmatningsreferensgenom och Illumina / Solexa läser korta filer eller AB SOLiD färgutrymme läser filer i olika format, som * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta etc. ZOOM matar ut mappningsresultaten för dessa korta läser på referenssekvensen. ZOOM Lite har en snabb och exakt kartläggningskärna baserad på en nyutformad multipelfrönteori. Både avläsningar med en ände och parade ändar i olika längder från 15 bp till 240 bp kan hanteras. Vilket antal fel som helst och en insättning / radering av olika längder mellan läsningen och dess målregion i referenssekvensen är tillåten. Unikt kartlagda resultat eller bästa (topp N) resultat för varje avläsning kommer att rapporteras i enlighet med minimala överensstämmelser och indelängd. Kvalitetsresultat används för att förbättra kartans noggrannhet. Baserat på kartläggningskärnan tillåter ZOOM Lite användare att ladda lokal läsdata och referenssekvensdata, välja lämpliga parametrar, bearbeta data med hög volym parallellt mellan upp till fyra CPU: er, övervaka körningsuppgifterna, lagra mappningsresultaten, visa graferna över kartlägga resultat och mata ut resultat i antingen * .BED- eller * .GFF-filformat för ytterligare kartläggning med UCSC-webbläsarspårinformation. Kartläggningsresultat kan ses i vilken som helst önskad skala, från lägdjupgrafen över en hel kromosom till detaljerade sekvensjusteringar mellan läsningar och referenssekvensen. Användare navigerar enkelt till regioner av intresse helt enkelt genom att klicka och dra eller rulla. ZOOM Lite är ett derivat av programvaran ZOOM Studio.

Ladda ner (41.79MB)

Similar Suggested Software