ZOOM Lite Загрузка и установка

Скачать (41.79MB)

ZOOM Lite О

ZOOM Lite Технические характеристики

Версия:
1.5

Размер файла:
41.79MB

Добавлен:
30 мая 2020 г.

Дата выпуска:
18 мая 2010 г.

Цена:
Free

Операционная система:
Windows XP/Vista/7,

Загрузки на прошлой неделе:
203

Дополнительные требования
Никт

ZOOM Lite v1.5

Карта миллионов коротких чтений, декодирование чтения в цветовом пространстве, визуализация результатов сопоставления

ZOOM Lite Скриншоты

ZOOM Lite Рейтинг редакции

ZOOM Lite - это программное обеспечение для отображения и визуализации данных следующего поколения. Пользователи вводят эталонные геномы и короткие чтения файлов Illumina / Solexa или цветовое пространство AB SOLiD для чтения файлов в различных форматах, таких как * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta и т. Д. ZOOM выводит результаты сопоставления этих коротких файлов. читает на ссылочной последовательности. ZOOM Lite имеет быстрое и точное картографическое ядро, основанное на недавно разработанной теории множественных начальных чисел. Могут обрабатываться как односторонние, так и парные операции чтения различной длины от 15 до 240 б.п. Любое количество несовпадений и один вставка / удаления различных длин между прочитанным и его целевой областью на эталонной последовательности разрешено. Уникально сопоставленные результаты или наилучшие (top N) результаты для каждого чтения будут сообщаться в соответствии с минимальными несовпадениями и неопределенной длиной. Показатели качества используются для повышения точности картирования. Основываясь на ядре сопоставления, ZOOM Lite позволяет пользователям загружать локальные данные чтения и данные эталонной последовательности, выбирать надлежащие параметры, параллельно обрабатывать большие объемы данных между четырьмя ЦП, отслеживать текущие задачи, сохранять результаты сопоставления, просматривать графики результаты сопоставления и результаты сопоставления выходных данных в форматах файлов * .BED или * .GFF для дальнейшей съемки с помощью информации о дорожках браузера UCSC. Результаты картирования можно просматривать в любом желаемом масштабе, от графика глубины чтения по всей хромосоме до детального выравнивания последовательностей между чтениями и эталонной последовательностью. Пользователи могут легко перемещаться по интересующим регионам простым нажатием и перетаскиванием или прокруткой. ZOOM Lite является производной от программного обеспечения ZOOM Studio.

Скачать (41.79MB)

Similar Suggested Software